Protein–RNA interactions for Protein: A5LHX3

PSMB11, Proteasome subunit beta type-11, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB11A5LHX3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSMB11A5LHX3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB11A5LHX3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMB11A5LHX3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMB11A5LHX3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMB11A5LHX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMB11A5LHX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMB11A5LHX3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMB11A5LHX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB11A5LHX3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms