Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PIPSLA2A3N6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIPSLA2A3N6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIPSLA2A3N6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIPSLA2A3N6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PIPSLA2A3N6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PIPSLA2A3N6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PIPSLA2A3N6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PIPSLA2A3N6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIPSLA2A3N6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PIPSLA2A3N6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PIPSLA2A3N6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PIPSLA2A3N6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PIPSLA2A3N6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIPSLA2A3N6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIPSLA2A3N6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms