Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A0A1B0GVI7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A1B0GVI7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1B0GVI7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1B0GVI7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1B0GVI7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVI7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A1B0GVI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A1B0GVI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1B0GVI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1B0GVI7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A1B0GVI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A1B0GVI7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A1B0GVI7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A1B0GVI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A1B0GVI7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms