Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRBV5-3A0A0A0MS03 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRBV5-3A0A0A0MS03 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRBV5-3A0A0A0MS03 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRBV5-3A0A0A0MS03 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms