Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S9

IGKV1D-37, Immunoglobulin kappa variable 1-37 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-37A0A075B6S9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-37A0A075B6S9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGKV1D-37A0A075B6S9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGKV1D-37A0A075B6S9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGKV1D-37A0A075B6S9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGKV1D-37A0A075B6S9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1D-37A0A075B6S9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-37A0A075B6S9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1D-37A0A075B6S9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1D-37A0A075B6S9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV1D-37A0A075B6S9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms