Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV24-1A0A075B6N3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV24-1A0A075B6N3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV24-1A0A075B6N3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV24-1A0A075B6N3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRBV24-1A0A075B6N3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRBV24-1A0A075B6N3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRBV24-1A0A075B6N3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRBV24-1A0A075B6N3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms