Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N3

TRBV24-1, T-cell receptor beta variable 24-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV24-1A0A075B6N3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRBV24-1A0A075B6N3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRBV24-1A0A075B6N3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRBV24-1A0A075B6N3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRBV24-1A0A075B6N3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRBV24-1A0A075B6N3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBV24-1A0A075B6N3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV24-1A0A075B6N3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBV24-1A0A075B6N3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV24-1A0A075B6N3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV24-1A0A075B6N3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV24-1A0A075B6N3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRBV24-1A0A075B6N3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV24-1A0A075B6N3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBV24-1A0A075B6N3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV24-1A0A075B6N3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRBV24-1A0A075B6N3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV24-1A0A075B6N3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV24-1A0A075B6N3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV24-1A0A075B6N3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV24-1A0A075B6N3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV24-1A0A075B6N3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV24-1A0A075B6N3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV24-1A0A075B6N3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRBV24-1A0A075B6N3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV24-1A0A075B6N3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV24-1A0A075B6N3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV24-1A0A075B6N3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV24-1A0A075B6N3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV24-1A0A075B6N3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV24-1A0A075B6N3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV24-1A0A075B6N3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV24-1A0A075B6N3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV24-1A0A075B6N3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV24-1A0A075B6N3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV24-1A0A075B6N3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRBV24-1A0A075B6N3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV24-1A0A075B6N3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV24-1A0A075B6N3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV24-1A0A075B6N3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBV24-1A0A075B6N3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV24-1A0A075B6N3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV24-1A0A075B6N3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV24-1A0A075B6N3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV24-1A0A075B6N3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV24-1A0A075B6N3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV24-1A0A075B6N3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV24-1A0A075B6N3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV24-1A0A075B6N3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV24-1A0A075B6N3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV24-1A0A075B6N3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV24-1A0A075B6N3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV24-1A0A075B6N3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV24-1A0A075B6N3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV24-1A0A075B6N3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV24-1A0A075B6N3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV24-1A0A075B6N3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRBV24-1A0A075B6N3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV24-1A0A075B6N3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV24-1A0A075B6N3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV24-1A0A075B6N3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV24-1A0A075B6N3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV24-1A0A075B6N3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV24-1A0A075B6N3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV24-1A0A075B6N3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV24-1A0A075B6N3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV24-1A0A075B6N3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV24-1A0A075B6N3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV24-1A0A075B6N3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV24-1A0A075B6N3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV24-1A0A075B6N3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV24-1A0A075B6N3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV24-1A0A075B6N3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV24-1A0A075B6N3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV24-1A0A075B6N3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV24-1A0A075B6N3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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