Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms