Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms