RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452779.2

CSAG1-204, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-204ENST00000452779 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.52■■■□□ 2.96
CSAG1-204ENST00000452779 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.85■■■□□ 2.37
CSAG1-204ENST00000452779 ABCC9O60706 1549 aa29.16■■■□□ 2.26
CSAG1-204ENST00000452779 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.1■■■□□ 2.09
CSAG1-204ENST00000452779 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
CSAG1-204ENST00000452779 NACADO15069 1562 aa28.05■■■□□ 2.08
CSAG1-204ENST00000452779 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CSAG1-204ENST00000452779 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.85■■■□□ 2.05
CSAG1-204ENST00000452779 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.73■■■□□ 2.03
CSAG1-204ENST00000452779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.47■■□□□ 1.99
CSAG1-204ENST00000452779 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.25■■□□□ 1.95
CSAG1-204ENST00000452779 SCRIBQ14160 1630 aa27.22■■□□□ 1.95
CSAG1-204ENST00000452779 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.17■■□□□ 1.94
CSAG1-204ENST00000452779 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.93■■□□□ 1.9
CSAG1-204ENST00000452779 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.68■■□□□ 1.86
CSAG1-204ENST00000452779 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CSAG1-204ENST00000452779 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.39■■□□□ 1.81
CSAG1-204ENST00000452779 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.2■■□□□ 1.78
CSAG1-204ENST00000452779 SMARCA4P51532 1647 aa26.03■■□□□ 1.76
CSAG1-204ENST00000452779 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CSAG1-204ENST00000452779 SMARCA2P51531 1590 aa25.88■■□□□ 1.73
CSAG1-204ENST00000452779 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.85■■□□□ 1.73
CSAG1-204ENST00000452779 NCAPD3P42695 1498 aa25.84■■□□□ 1.73
CSAG1-204ENST00000452779 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.82■■□□□ 1.72
CSAG1-204ENST00000452779 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.74■■□□□ 1.71
CSAG1-204ENST00000452779 HMGXB3Q12766 1538 aa25.73■■□□□ 1.71
CSAG1-204ENST00000452779 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CSAG1-204ENST00000452779 WIZO95785 1651 aa25.58■■□□□ 1.69
CSAG1-204ENST00000452779 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CSAG1-204ENST00000452779 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CSAG1-204ENST00000452779 NESP48681 1621 aa25.21■■□□□ 1.63
CSAG1-204ENST00000452779 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.21■■□□□ 1.63
CSAG1-204ENST00000452779 ERCC6Q03468 1493 aa25.19■■□□□ 1.62
CSAG1-204ENST00000452779 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.1■■□□□ 1.61
CSAG1-204ENST00000452779 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.04■■□□□ 1.6
CSAG1-204ENST00000452779 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.98■■□□□ 1.59
CSAG1-204ENST00000452779 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.98■■□□□ 1.59
CSAG1-204ENST00000452779 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CSAG1-204ENST00000452779 CFTRP13569 1480 aa24.94■■□□□ 1.58
CSAG1-204ENST00000452779 CUX2O14529 1486 aa24.88■■□□□ 1.57
CSAG1-204ENST00000452779 PRDM2Q13029 1718 aa24.86■■□□□ 1.57
CSAG1-204ENST00000452779 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CSAG1-204ENST00000452779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.83■■□□□ 1.56
CSAG1-204ENST00000452779 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG1-204ENST00000452779 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG1-204ENST00000452779 WDR62O43379 1518 aa24.66■■□□□ 1.54
CSAG1-204ENST00000452779 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CSAG1-204ENST00000452779 ABCC8Q09428 1581 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG1-204ENST00000452779 TOPBP1Q92547 1522 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG1-204ENST00000452779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG1-204ENST00000452779 IFT140Q96RY7 1462 aa24.28■■□□□ 1.48
CSAG1-204ENST00000452779 CUX1P39880 1505 aa24.22■■□□□ 1.47
CSAG1-204ENST00000452779 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
CSAG1-204ENST00000452779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.16■■□□□ 1.46
CSAG1-204ENST00000452779 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CSAG1-204ENST00000452779 SOGA1O94964 1423 aa24.14■■□□□ 1.45
CSAG1-204ENST00000452779 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CSAG1-204ENST00000452779 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
CSAG1-204ENST00000452779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.09■■□□□ 1.45
CSAG1-204ENST00000452779 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.09■■□□□ 1.45
CSAG1-204ENST00000452779 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CSAG1-204ENST00000452779 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.06■■□□□ 1.44
CSAG1-204ENST00000452779 TOP2BQ02880 1626 aa24.05■■□□□ 1.44
CSAG1-204ENST00000452779 SYNJ1O43426 1573 aa24.02■■□□□ 1.44
CSAG1-204ENST00000452779 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.437e-7■■■□□ 16.6
CSAG1-204ENST00000452779 WDR97A6NE52 1622 aa24■■□□□ 1.43
CSAG1-204ENST00000452779 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CSAG1-204ENST00000452779 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.92■■□□□ 1.42
CSAG1-204ENST00000452779 OSCARQ8IYS5 282 aa23.89■■□□□ 1.41
CSAG1-204ENST00000452779 GRIN2BQ13224 1484 aa23.86■■□□□ 1.41
CSAG1-204ENST00000452779 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.86■■□□□ 1.41
CSAG1-204ENST00000452779 PBRM1Q86U86 1689 aa23.85■■□□□ 1.41
CSAG1-204ENST00000452779 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.83■■□□□ 1.41
CSAG1-204ENST00000452779 CHD1O14646 1710 aa23.82■■□□□ 1.4
CSAG1-204ENST00000452779 FBLN2P98095 1184 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG1-204ENST00000452779 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.8■■□□□ 1.4
CSAG1-204ENST00000452779 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CSAG1-204ENST00000452779 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CSAG1-204ENST00000452779 SYNJ2O15056 1496 aa23.69■■□□□ 1.38
CSAG1-204ENST00000452779 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.65■■□□□ 1.38
CSAG1-204ENST00000452779 KIF27Q86VH2 1401 aa23.62■■□□□ 1.37
CSAG1-204ENST00000452779 ADAMTS12P58397 1594 aa23.61■■□□□ 1.37
CSAG1-204ENST00000452779 TRIM41Q8WV44 630 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAG1-204ENST00000452779 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.59■■□□□ 1.37
CSAG1-204ENST00000452779 GRIN2AQ12879 1464 aa23.53■■□□□ 1.36
CSAG1-204ENST00000452779 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.49■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 CUL7Q14999 1698 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.48■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 IGF1RP08069 1367 aa23.47■■□□□ 1.35
CSAG1-204ENST00000452779 ARHGEF11O15085 1522 aa23.45■■□□□ 1.34
CSAG1-204ENST00000452779 CEP170Q5SW79 1584 aa23.4■■□□□ 1.34
CSAG1-204ENST00000452779 NUP160Q12769 1436 aa23.4■■□□□ 1.34
CSAG1-204ENST00000452779 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.37■■□□□ 1.33
CSAG1-204ENST00000452779 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.34■■□□□ 1.33
CSAG1-204ENST00000452779 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.27■■□□□ 1.32
CSAG1-204ENST00000452779 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.25■■□□□ 1.31
CSAG1-204ENST00000452779 SHROOM2Q13796 1616 aa23.25■■□□□ 1.31
CSAG1-204ENST00000452779 ARAP1Q96P48 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms