Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms