RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.76■■■□□ 2.83
RFX8-201ENST00000428343 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.83■■■□□ 2.21
RFX8-201ENST00000428343 ABCC9O60706 1549 aa28.07■■■□□ 2.08
RFX8-201ENST00000428343 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.52■■■□□ 2
RFX8-201ENST00000428343 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RFX8-201ENST00000428343 NACADO15069 1562 aa27.07■■□□□ 1.92
RFX8-201ENST00000428343 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.04■■□□□ 1.92
RFX8-201ENST00000428343 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.01■■□□□ 1.91
RFX8-201ENST00000428343 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
RFX8-201ENST00000428343 SCRIBQ14160 1630 aa26.52■■□□□ 1.84
RFX8-201ENST00000428343 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
RFX8-201ENST00000428343 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.38■■□□□ 1.81
RFX8-201ENST00000428343 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.37■■□□□ 1.81
RFX8-201ENST00000428343 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.19■■□□□ 1.78
RFX8-201ENST00000428343 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.56■■□□□ 1.68
RFX8-201ENST00000428343 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RFX8-201ENST00000428343 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.44■■□□□ 1.66
RFX8-201ENST00000428343 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RFX8-201ENST00000428343 SMARCA4P51532 1647 aa25.32■■□□□ 1.64
RFX8-201ENST00000428343 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.32■■□□□ 1.64
RFX8-201ENST00000428343 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.3■■□□□ 1.64
RFX8-201ENST00000428343 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RFX8-201ENST00000428343 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.12■■□□□ 1.61
RFX8-201ENST00000428343 SMARCA2P51531 1590 aa25.06■■□□□ 1.6
RFX8-201ENST00000428343 WIZO95785 1651 aa25.04■■□□□ 1.6
RFX8-201ENST00000428343 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
RFX8-201ENST00000428343 NCAPD3P42695 1498 aa25■■□□□ 1.59
RFX8-201ENST00000428343 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.99■■□□□ 1.59
RFX8-201ENST00000428343 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RFX8-201ENST00000428343 HMGXB3Q12766 1538 aa24.88■■□□□ 1.57
RFX8-201ENST00000428343 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RFX8-201ENST00000428343 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.53■■□□□ 1.52
RFX8-201ENST00000428343 NESP48681 1621 aa24.39■■□□□ 1.5
RFX8-201ENST00000428343 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.36■■□□□ 1.49
RFX8-201ENST00000428343 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.26■■□□□ 1.47
RFX8-201ENST00000428343 CFTRP13569 1480 aa24.25■■□□□ 1.47
RFX8-201ENST00000428343 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.16■■□□□ 1.46
RFX8-201ENST00000428343 ERCC6Q03468 1493 aa24.16■■□□□ 1.46
RFX8-201ENST00000428343 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.09■■□□□ 1.45
RFX8-201ENST00000428343 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.02■■□□□ 1.44
RFX8-201ENST00000428343 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.01■■□□□ 1.43
RFX8-201ENST00000428343 PRDM2Q13029 1718 aa23.98■■□□□ 1.43
RFX8-201ENST00000428343 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.87■■□□□ 1.41
RFX8-201ENST00000428343 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
RFX8-201ENST00000428343 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
RFX8-201ENST00000428343 ABCC8Q09428 1581 aa23.79■■□□□ 1.4
RFX8-201ENST00000428343 WDR62O43379 1518 aa23.73■■□□□ 1.39
RFX8-201ENST00000428343 TOPBP1Q92547 1522 aa23.73■■□□□ 1.39
RFX8-201ENST00000428343 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
RFX8-201ENST00000428343 CUX1P39880 1505 aa23.69■■□□□ 1.38
RFX8-201ENST00000428343 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.69■■□□□ 1.38
RFX8-201ENST00000428343 CUX2O14529 1486 aa23.63■■□□□ 1.37
RFX8-201ENST00000428343 SYNJ1O43426 1573 aa23.61■■□□□ 1.37
RFX8-201ENST00000428343 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.58■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 TRIM41Q8WV44 630 aa23.56■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 TOP2BQ02880 1626 aa23.55■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 SOGA1O94964 1423 aa23.52■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.52■■□□□ 1.36
RFX8-201ENST00000428343 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.51■■□□□ 1.35
RFX8-201ENST00000428343 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.48■■□□□ 1.35
RFX8-201ENST00000428343 IFT140Q96RY7 1462 aa23.46■■□□□ 1.35
RFX8-201ENST00000428343 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
RFX8-201ENST00000428343 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RFX8-201ENST00000428343 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RFX8-201ENST00000428343 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
RFX8-201ENST00000428343 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.31■■□□□ 1.32
RFX8-201ENST00000428343 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RFX8-201ENST00000428343 WDR97A6NE52 1622 aa23.23■■□□□ 1.31
RFX8-201ENST00000428343 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
RFX8-201ENST00000428343 KIF27Q86VH2 1401 aa23.19■■□□□ 1.3
RFX8-201ENST00000428343 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RFX8-201ENST00000428343 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX8-201ENST00000428343 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX8-201ENST00000428343 GRIN2BQ13224 1484 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX8-201ENST00000428343 FBLN2P98095 1184 aa23.11■■□□□ 1.29
RFX8-201ENST00000428343 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.09■■□□□ 1.29
RFX8-201ENST00000428343 PBRM1Q86U86 1689 aa23.07■■□□□ 1.28
RFX8-201ENST00000428343 IGF1RP08069 1367 aa23.06■■□□□ 1.28
RFX8-201ENST00000428343 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RFX8-201ENST00000428343 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.03■■□□□ 1.28
RFX8-201ENST00000428343 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
RFX8-201ENST00000428343 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.99■■□□□ 1.27
RFX8-201ENST00000428343 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.95■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 EEA1Q15075 1411 aa22.95■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.95■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 SYNJ2O15056 1496 aa22.94■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 ADAMTS12P58397 1594 aa22.92■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.92■■□□□ 1.26
RFX8-201ENST00000428343 CUL7Q14999 1698 aa22.88■■□□□ 1.25
RFX8-201ENST00000428343 CHD1O14646 1710 aa22.86■■□□□ 1.25
RFX8-201ENST00000428343 OSCARQ8IYS5 282 aa22.86■■□□□ 1.25
RFX8-201ENST00000428343 GRIN2AQ12879 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
RFX8-201ENST00000428343 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.82■■□□□ 1.24
RFX8-201ENST00000428343 PRXQ9BXM0 1461 aa22.81■■□□□ 1.24
RFX8-201ENST00000428343 CEP170Q5SW79 1584 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX8-201ENST00000428343 NUP160Q12769 1436 aa22.69■■□□□ 1.22
RFX8-201ENST00000428343 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RFX8-201ENST00000428343 KIF21BO75037 1637 aa22.66■■□□□ 1.22
RFX8-201ENST00000428343 GOLGA3Q08378 1498 aa22.63■■□□□ 1.21
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