Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXD10P28358 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXD10P28358 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms