Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMTNP53814 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMTNP53814 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMTNP53814 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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