Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms