RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403807.3

VPREB1-202, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB1, Length 755 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1-202ENST00000403807 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.72■■■□□ 2.83
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.93■■■□□ 2.22
VPREB1-202ENST00000403807 ABCC9O60706 1549 aa28.23■■■□□ 2.11
VPREB1-202ENST00000403807 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.43■■□□□ 1.98
VPREB1-202ENST00000403807 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
VPREB1-202ENST00000403807 NACADO15069 1562 aa27.23■■□□□ 1.95
VPREB1-202ENST00000403807 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.21■■□□□ 1.95
VPREB1-202ENST00000403807 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.13■■□□□ 1.93
VPREB1-202ENST00000403807 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.07■■□□□ 1.92
VPREB1-202ENST00000403807 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
VPREB1-202ENST00000403807 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.47■■□□□ 1.83
VPREB1-202ENST00000403807 SCRIBQ14160 1630 aa26.44■■□□□ 1.82
VPREB1-202ENST00000403807 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.33■■□□□ 1.8
VPREB1-202ENST00000403807 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.19■■□□□ 1.78
VPREB1-202ENST00000403807 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
VPREB1-202ENST00000403807 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
VPREB1-202ENST00000403807 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.5■■□□□ 1.67
VPREB1-202ENST00000403807 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.47■■□□□ 1.67
VPREB1-202ENST00000403807 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
VPREB1-202ENST00000403807 SMARCA4P51532 1647 aa25.31■■□□□ 1.64
VPREB1-202ENST00000403807 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.21■■□□□ 1.63
VPREB1-202ENST00000403807 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.18■■□□□ 1.62
VPREB1-202ENST00000403807 NCAPD3P42695 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
VPREB1-202ENST00000403807 SMARCA2P51531 1590 aa25.14■■□□□ 1.62
VPREB1-202ENST00000403807 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.06■■□□□ 1.6
VPREB1-202ENST00000403807 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
VPREB1-202ENST00000403807 HMGXB3Q12766 1538 aa24.99■■□□□ 1.59
VPREB1-202ENST00000403807 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
VPREB1-202ENST00000403807 WIZO95785 1651 aa24.92■■□□□ 1.58
VPREB1-202ENST00000403807 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
VPREB1-202ENST00000403807 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
VPREB1-202ENST00000403807 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.47■■□□□ 1.51
VPREB1-202ENST00000403807 NESP48681 1621 aa24.45■■□□□ 1.5
VPREB1-202ENST00000403807 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.45■■□□□ 1.5
VPREB1-202ENST00000403807 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.42■■□□□ 1.5
VPREB1-202ENST00000403807 ERCC6Q03468 1493 aa24.34■■□□□ 1.49
VPREB1-202ENST00000403807 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.33■■□□□ 1.49
VPREB1-202ENST00000403807 CFTRP13569 1480 aa24.32■■□□□ 1.48
VPREB1-202ENST00000403807 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.14■■□□□ 1.46
VPREB1-202ENST00000403807 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.1■■□□□ 1.45
VPREB1-202ENST00000403807 CUX2O14529 1486 aa24.09■■□□□ 1.45
VPREB1-202ENST00000403807 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.08■■□□□ 1.45
VPREB1-202ENST00000403807 PRDM2Q13029 1718 aa24.01■■□□□ 1.43
VPREB1-202ENST00000403807 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.01■■□□□ 1.43
VPREB1-202ENST00000403807 MRC2Q9UBG0 1479 aa24■■□□□ 1.43
VPREB1-202ENST00000403807 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
VPREB1-202ENST00000403807 WDR62O43379 1518 aa23.89■■□□□ 1.41
VPREB1-202ENST00000403807 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
VPREB1-202ENST00000403807 ABCC8Q09428 1581 aa23.82■■□□□ 1.4
VPREB1-202ENST00000403807 TOPBP1Q92547 1522 aa23.76■■□□□ 1.39
VPREB1-202ENST00000403807 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.73■■□□□ 1.39
VPREB1-202ENST00000403807 CUX1P39880 1505 aa23.63■■□□□ 1.37
VPREB1-202ENST00000403807 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
VPREB1-202ENST00000403807 IFT140Q96RY7 1462 aa23.59■■□□□ 1.37
VPREB1-202ENST00000403807 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
VPREB1-202ENST00000403807 SOGA1O94964 1423 aa23.55■■□□□ 1.36
VPREB1-202ENST00000403807 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.54■■□□□ 1.36
VPREB1-202ENST00000403807 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.49■■□□□ 1.35
VPREB1-202ENST00000403807 TOP2BQ02880 1626 aa23.48■■□□□ 1.35
VPREB1-202ENST00000403807 SYNJ1O43426 1573 aa23.45■■□□□ 1.34
VPREB1-202ENST00000403807 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
VPREB1-202ENST00000403807 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.44■■□□□ 1.34
VPREB1-202ENST00000403807 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
VPREB1-202ENST00000403807 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
VPREB1-202ENST00000403807 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
VPREB1-202ENST00000403807 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.33■■□□□ 1.33
VPREB1-202ENST00000403807 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
VPREB1-202ENST00000403807 WDR97A6NE52 1622 aa23.29■■□□□ 1.32
VPREB1-202ENST00000403807 TRIM41Q8WV44 630 aa23.28■■□□□ 1.32
VPREB1-202ENST00000403807 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.24■■□□□ 1.31
VPREB1-202ENST00000403807 GRIN2BQ13224 1484 aa23.21■■□□□ 1.31
VPREB1-202ENST00000403807 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
VPREB1-202ENST00000403807 FBLN2P98095 1184 aa23.14■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 OSCARQ8IYS5 282 aa23.14■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.12■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 KIF27Q86VH2 1401 aa23.12■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.09■■□□□ 1.29
VPREB1-202ENST00000403807 PBRM1Q86U86 1689 aa23.07■■□□□ 1.28
VPREB1-202ENST00000403807 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
VPREB1-202ENST00000403807 SYNJ2O15056 1496 aa23.03■■□□□ 1.28
VPREB1-202ENST00000403807 IGF1RP08069 1367 aa23.01■■□□□ 1.27
VPREB1-202ENST00000403807 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.99■■□□□ 1.27
VPREB1-202ENST00000403807 CHD1O14646 1710 aa22.95■■□□□ 1.26
VPREB1-202ENST00000403807 ADAMTS12P58397 1594 aa22.93■■□□□ 1.26
VPREB1-202ENST00000403807 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.92■■□□□ 1.26
VPREB1-202ENST00000403807 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.89■■□□□ 1.26
VPREB1-202ENST00000403807 GRIN2AQ12879 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
VPREB1-202ENST00000403807 CUL7Q14999 1698 aa22.84■■□□□ 1.25
VPREB1-202ENST00000403807 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.81■■□□□ 1.24
VPREB1-202ENST00000403807 EEA1Q15075 1411 aa22.81■■□□□ 1.24
VPREB1-202ENST00000403807 NUP160Q12769 1436 aa22.78■■□□□ 1.24
VPREB1-202ENST00000403807 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
VPREB1-202ENST00000403807 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.74■■□□□ 1.23
VPREB1-202ENST00000403807 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.74■■□□□ 1.23
VPREB1-202ENST00000403807 CEP170Q5SW79 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
VPREB1-202ENST00000403807 PRXQ9BXM0 1461 aa22.68■■□□□ 1.22
VPREB1-202ENST00000403807 JPH4Q96JJ6 628 aa22.66■■□□□ 1.22
VPREB1-202ENST00000403807 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms