Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARID3CA6NKF2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms