RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278499.6

SESN3-201, Transcript of sestrin 3, humanhuman

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Gene SESN3, Length 1,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3-201ENST00000278499 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.05■■■□□ 2.72
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SESN3-201ENST00000278499 NACADO15069 1562 aa26.93■■□□□ 1.9
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SESN3-201ENST00000278499 SCRIBQ14160 1630 aa26.13■■□□□ 1.77
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SESN3-201ENST00000278499 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.55■■□□□ 1.68
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SESN3-201ENST00000278499 SMARCA2P51531 1590 aa24.8■■□□□ 1.56
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SESN3-201ENST00000278499 NESP48681 1621 aa24.42■■□□□ 1.5
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SESN3-201ENST00000278499 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.15■■□□□ 1.46
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SESN3-201ENST00000278499 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.06■■□□□ 1.44
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SESN3-201ENST00000278499 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.9■■□□□ 1.42
SESN3-201ENST00000278499 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.9■■□□□ 1.42
SESN3-201ENST00000278499 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.88■■□□□ 1.41
SESN3-201ENST00000278499 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.88■■□□□ 1.41
SESN3-201ENST00000278499 WDR62O43379 1518 aa23.81■■□□□ 1.4
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SESN3-201ENST00000278499 PRDM2Q13029 1718 aa23.66■■□□□ 1.38
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SESN3-201ENST00000278499 TOPBP1Q92547 1522 aa23.47■■□□□ 1.35
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SESN3-201ENST00000278499 IFT140Q96RY7 1462 aa23.38■■□□□ 1.33
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SESN3-201ENST00000278499 FBLN2P98095 1184 aa22.99■■□□□ 1.27
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SESN3-201ENST00000278499 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
SESN3-201ENST00000278499 WDR97A6NE52 1622 aa22.96■■□□□ 1.27
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SESN3-201ENST00000278499 CHD1O14646 1710 aa22.93■■□□□ 1.26
SESN3-201ENST00000278499 SYNJ1O43426 1573 aa22.92■■□□□ 1.26
SESN3-201ENST00000278499 GRIN2BQ13224 1484 aa22.91■■□□□ 1.26
SESN3-201ENST00000278499 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.91■■□□□ 1.26
SESN3-201ENST00000278499 TOP2BQ02880 1626 aa22.9■■□□□ 1.26
SESN3-201ENST00000278499 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.89■■□□□ 1.25
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SESN3-201ENST00000278499 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
SESN3-201ENST00000278499 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.82■■□□□ 1.24
SESN3-201ENST00000278499 PBRM1Q86U86 1689 aa22.82■■□□□ 1.24
SESN3-201ENST00000278499 ARHGEF11O15085 1522 aa22.81■■□□□ 1.24
SESN3-201ENST00000278499 SYNJ2O15056 1496 aa22.8■■□□□ 1.24
SESN3-201ENST00000278499 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.69■■□□□ 1.22
SESN3-201ENST00000278499 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.66■■□□□ 1.22
SESN3-201ENST00000278499 ADAMTS12P58397 1594 aa22.65■■□□□ 1.22
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SESN3-201ENST00000278499 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
SESN3-201ENST00000278499 CEP170Q5SW79 1584 aa22.53■■□□□ 1.2
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SESN3-201ENST00000278499 KIF27Q86VH2 1401 aa22.5■■□□□ 1.19
SESN3-201ENST00000278499 IGF1RP08069 1367 aa22.44■■□□□ 1.18
SESN3-201ENST00000278499 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.4■■□□□ 1.18
SESN3-201ENST00000278499 CUL7Q14999 1698 aa22.35■■□□□ 1.17
SESN3-201ENST00000278499 SHROOM2Q13796 1616 aa22.34■■□□□ 1.17
SESN3-201ENST00000278499 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.32■■□□□ 1.16
SESN3-201ENST00000278499 JPH4Q96JJ6 628 aa22.31■■□□□ 1.16
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