Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
GCSAMQ8N6F7 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms