Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HS2ST1Q7LGA3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms