Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 BEAN1-207ENST00000564819 2929 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 TRIM31-210ENST00000376734 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 ARHGEF9-218ENST00000624843 2154 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CD300CQ08708 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms