Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAD1L1Q9Y6D9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms