Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDIT4Q9NX09 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT4Q9NX09 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms