Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRA1Q9HD15 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRA1Q9HD15 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms