Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP110Q9HB58 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP110Q9HB58 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms