Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRTNQ99748 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRTNQ99748 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRTNQ99748 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRTNQ99748 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRTNQ99748 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRTNQ99748 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms