Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJA10Q969M2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJA10Q969M2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJA10Q969M2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms