Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms