Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK2Q8IWQ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK2Q8IWQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms