Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL38Q2WGJ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL38Q2WGJ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms