Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
GOLGA3Q08378 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
GOLGA3Q08378 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
GOLGA3Q08378 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms