Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFTPDP35247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFTPDP35247 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFTPDP35247 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms