Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SRIP30626 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SRIP30626 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SRIP30626 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SRIP30626 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRIP30626 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRIP30626 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRIP30626 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SRIP30626 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SRIP30626 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SRIP30626 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SRIP30626 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRIP30626 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms