Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
IGHV3-11P01762 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IGHV3-11P01762 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms