Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.172e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.42e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-202ENST00000412198 3611 ntTSL 212.15□□□□□ -0.462e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-214ENST00000603187 3713 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.492e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-217ENST00000603409 842 ntTSL 511.65□□□□□ -0.542e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 ZSWIM8-222ENST00000604754 3369 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.572e-13■■■■□ 26
PRPF4O43172 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.141e-8■■■■□ 26
PRPF4O43172 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.241e-8■■■■□ 26
PRPF4O43172 PNCK-230ENST00000488168 976 ntTSL 316.48■□□□□ 0.231e-8■■■■□ 26
PRPF4O43172 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.125e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.336e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 518.06■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 315.11■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 210.65□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.047e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.313e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 RPA2-205ENST00000444045 682 ntTSL 514.69□□□□□ -0.063e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.046e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 MIR210HG-202ENST00000528245 659 ntTSL 315.28■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 ABCA2-209ENST00000463603 655 ntTSL 314.41□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-8■■■■□ 25.9
PRPF4O43172 AIFM3-209ENST00000465606 1592 ntTSL 519.4■□□□□ 0.73e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 AIFM3-214ENST00000483107 1325 ntTSL 518.36■□□□□ 0.533e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 AIFM3-216ENST00000486003 2850 ntTSL 214.28□□□□□ -0.123e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 IGSF1-203ENST00000370901 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.63e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.63e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 IGSF1-202ENST00000370900 1786 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 POLR2H-209ENST00000460083 439 ntTSL 315.38■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 TM7SF2-203ENST00000524690 843 ntTSL 518.12■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 CARD10-207ENST00000476871 583 ntTSL 419.52■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 PLXNB2-206ENST00000434732 253 ntTSL 212.82□□□□□ -0.364e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 MST1-204ENST00000479115 2285 ntTSL 523.24■■□□□ 1.312e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 MST1-215ENST00000492329 2006 ntTSL 519.39■□□□□ 0.692e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-208ENST00000450385 815 ntTSL 315.35■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 25.8
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PRPF4O43172 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 SGCE-203ENST00000425444 597 ntTSL 312.1□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.541e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.421e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.271e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 218.14■□□□□ 0.496e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.041e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 25.8
PRPF4O43172 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 35.7□□□□□ -1.54e-11■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.535e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 HNF1A-207ENST00000540108 3039 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.088e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.228e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.425e-10■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-203ENST00000438545 1025 ntTSL 520.69■□□□□ 0.95e-10■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-10■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-202ENST00000375403 3164 ntTSL 211.15□□□□□ -0.625e-10■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.273e-9■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 IDI1-203ENST00000429642 1017 ntTSL 521.61■■□□□ 1.053e-9■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)19.45■□□□□ 0.73e-9■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 IDI1-204ENST00000482091 1029 ntTSL 512.93□□□□□ -0.343e-9■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 HK2-203ENST00000472302 395 ntTSL 34.34□□□□□ -1.716e-8■■■■□ 25.7
PRPF4O43172 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)22.61■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 25.6
PRPF4O43172 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.863e-7■■■■□ 25.6
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