Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TAC3-205ENST00000415231 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC090587.1-201ENST00000415809 494 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 AC069366.2-201ENST00000583643 430 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATRXP46100 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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