RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488201.1

SYNPR-AS1-201, SYNPR antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYNPR-AS1, Length 558 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.37■■□□□ 1.97
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ABCC9O60706 1549 aa25.96■■□□□ 1.75
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.22■■□□□ 1.63
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.02■■□□□ 1.6
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.3■■□□□ 1.48
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.92■■□□□ 1.42
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NACADO15069 1562 aa23.88■■□□□ 1.41
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.74■■□□□ 1.39
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.6■■□□□ 1.37
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.57■■□□□ 1.36
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.41■■□□□ 1.34
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.22■■□□□ 1.31
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.2■■□□□ 1.3
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CUX2O14529 1486 aa22.79■■□□□ 1.24
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SCRIBQ14160 1630 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ERCC6Q03468 1493 aa22.5■■□□□ 1.19
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TRIM41Q8WV44 630 aa22.46■■□□□ 1.19
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NCAPD3P42695 1498 aa22.06■■□□□ 1.12
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NESP48681 1621 aa22.01■■□□□ 1.11
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.83■■□□□ 1.08
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 HMGXB3Q12766 1538 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SMARCA2P51531 1590 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 OSCARQ8IYS5 282 aa21.61■■□□□ 1.05
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SMARCA4P51532 1647 aa21.57■■□□□ 1.04
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.49■■□□□ 1.03
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 WDR62O43379 1518 aa21.47■■□□□ 1.03
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.42■■□□□ 1.02
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.36■■□□□ 1.01
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.34■■□□□ 1.01
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ARHGEF11O15085 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.21■□□□□ 0.99
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.17■□□□□ 0.98
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.09■□□□□ 0.97
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.07■□□□□ 0.96
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ARAP1Q96P48 1450 aa20.95■□□□□ 0.94
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CFTRP13569 1480 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 IFT140Q96RY7 1462 aa20.82■□□□□ 0.92
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 WIZO95785 1651 aa20.78■□□□□ 0.92
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CHD1O14646 1710 aa20.77■□□□□ 0.92
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 FBLN2P98095 1184 aa20.67■□□□□ 0.9
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 PRDM2Q13029 1718 aa20.62■□□□□ 0.89
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TOPBP1Q92547 1522 aa20.58■□□□□ 0.89
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ABCC8Q09428 1581 aa20.51■□□□□ 0.87
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.48■□□□□ 0.87
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.42■□□□□ 0.86
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SYNJ1O43426 1573 aa20.41■□□□□ 0.86
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.37■□□□□ 0.85
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.32■□□□□ 0.84
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.24■□□□□ 0.83
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.23■□□□□ 0.83
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SOGA1O94964 1423 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 WDR97A6NE52 1622 aa20.21■□□□□ 0.83
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.2■□□□□ 0.82
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SYNJ2O15056 1496 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.19■□□□□ 0.82
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 GRIN2BQ13224 1484 aa20.15■□□□□ 0.82
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.08■□□□□ 0.81
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.04■□□□□ 0.8
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 PBRM1Q86U86 1689 aa20■□□□□ 0.79
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.98■□□□□ 0.79
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CEP170Q5SW79 1584 aa19.97■□□□□ 0.79
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 KDM6BO15054 1643 aa19.96■□□□□ 0.79
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.93■□□□□ 0.78
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 SHROOM2Q13796 1616 aa19.88■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 GRIN2AQ12879 1464 aa19.88■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 DIP2BQ9P265 1576 aa19.85■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.85■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 CUX1P39880 1505 aa19.85■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 NUP160Q12769 1436 aa19.84■□□□□ 0.77
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 MAPKBP1O60336 1514 aa19.81■□□□□ 0.76
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.81■□□□□ 0.76
SYNPR-AS1-201ENST00000488201 FBXO41Q8TF61 875 aa19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms