Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
C4orf47A7E2U8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms