Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UBASH3A-201ENST00000291535 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTSK-201ENST00000271651 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MYCNOS-202ENST00000641263 1313 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDKL1-201ENST00000216378 2209 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT12-201ENST00000328599 2207 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IRAK2-201ENST00000256458 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPDYE5-202ENST00000624640 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP36-206ENST00000639280 2685 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KRT38-201ENST00000246646 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THRAP3P1-201ENST00000411753 2786 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms