Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNA1P78396 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms