RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453707.6

CITED1-209, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CITED1, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-209ENST00000453707 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.67■■■□□ 2.82
CITED1-209ENST00000453707 ABCC9O60706 1549 aa29.3■■■□□ 2.28
CITED1-209ENST00000453707 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.2■■■□□ 2.27
CITED1-209ENST00000453707 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.86■■■□□ 2.05
CITED1-209ENST00000453707 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.82■■■□□ 2.04
CITED1-209ENST00000453707 NACADO15069 1562 aa27.67■■■□□ 2.02
CITED1-209ENST00000453707 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.36■■□□□ 1.97
CITED1-209ENST00000453707 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
CITED1-209ENST00000453707 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.26■■□□□ 1.95
CITED1-209ENST00000453707 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.07■■□□□ 1.92
CITED1-209ENST00000453707 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CITED1-209ENST00000453707 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.94■■□□□ 1.9
CITED1-209ENST00000453707 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.94■■□□□ 1.9
CITED1-209ENST00000453707 SCRIBQ14160 1630 aa26.72■■□□□ 1.87
CITED1-209ENST00000453707 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
CITED1-209ENST00000453707 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.39■■□□□ 1.82
CITED1-209ENST00000453707 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.37■■□□□ 1.81
CITED1-209ENST00000453707 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CITED1-209ENST00000453707 NCAPD3P42695 1498 aa25.54■■□□□ 1.68
CITED1-209ENST00000453707 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.49■■□□□ 1.67
CITED1-209ENST00000453707 SMARCA4P51532 1647 aa25.44■■□□□ 1.66
CITED1-209ENST00000453707 SMARCA2P51531 1590 aa25.44■■□□□ 1.66
CITED1-209ENST00000453707 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CITED1-209ENST00000453707 ERCC6Q03468 1493 aa25.35■■□□□ 1.65
CITED1-209ENST00000453707 HMGXB3Q12766 1538 aa25.33■■□□□ 1.65
CITED1-209ENST00000453707 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CITED1-209ENST00000453707 CUX2O14529 1486 aa25.19■■□□□ 1.62
CITED1-209ENST00000453707 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.16■■□□□ 1.62
CITED1-209ENST00000453707 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED1-209ENST00000453707 NESP48681 1621 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED1-209ENST00000453707 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED1-209ENST00000453707 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED1-209ENST00000453707 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED1-209ENST00000453707 WIZO95785 1651 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED1-209ENST00000453707 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED1-209ENST00000453707 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CITED1-209ENST00000453707 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.74■■□□□ 1.55
CITED1-209ENST00000453707 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CITED1-209ENST00000453707 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.63■■□□□ 1.53
CITED1-209ENST00000453707 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.57■■□□□ 1.52
CITED1-209ENST00000453707 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CITED1-209ENST00000453707 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.54■■□□□ 1.52
CITED1-209ENST00000453707 CFTRP13569 1480 aa24.51■■□□□ 1.51
CITED1-209ENST00000453707 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
CITED1-209ENST00000453707 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.32■■□□□ 1.48
CITED1-209ENST00000453707 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CITED1-209ENST00000453707 TRIM41Q8WV44 630 aa24.19■■□□□ 1.46
CITED1-209ENST00000453707 OSCARQ8IYS5 282 aa24.16■■□□□ 1.46
CITED1-209ENST00000453707 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
CITED1-209ENST00000453707 IFT140Q96RY7 1462 aa24.07■■□□□ 1.44
CITED1-209ENST00000453707 TOPBP1Q92547 1522 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-209ENST00000453707 ABCC8Q09428 1581 aa24.05■■□□□ 1.44
CITED1-209ENST00000453707 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CITED1-209ENST00000453707 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.95■■□□□ 1.43
CITED1-209ENST00000453707 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CITED1-209ENST00000453707 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.41
CITED1-209ENST00000453707 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CITED1-209ENST00000453707 FBLN2P98095 1184 aa23.82■■□□□ 1.4
CITED1-209ENST00000453707 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
CITED1-209ENST00000453707 SOGA1O94964 1423 aa23.78■■□□□ 1.4
CITED1-209ENST00000453707 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CITED1-209ENST00000453707 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.75■■□□□ 1.39
CITED1-209ENST00000453707 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CITED1-209ENST00000453707 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-209ENST00000453707 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-209ENST00000453707 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.69■■□□□ 1.38
CITED1-209ENST00000453707 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.68■■□□□ 1.38
CITED1-209ENST00000453707 ARHGEF11O15085 1522 aa23.65■■□□□ 1.38
CITED1-209ENST00000453707 CUX1P39880 1505 aa23.64■■□□□ 1.37
CITED1-209ENST00000453707 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED1-209ENST00000453707 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CITED1-209ENST00000453707 CHD1O14646 1710 aa23.61■■□□□ 1.37
CITED1-209ENST00000453707 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.58■■□□□ 1.37
CITED1-209ENST00000453707 WDR97A6NE52 1622 aa23.55■■□□□ 1.36
CITED1-209ENST00000453707 GRIN2BQ13224 1484 aa23.54■■□□□ 1.36
CITED1-209ENST00000453707 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CITED1-209ENST00000453707 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.47■■□□□ 1.35
CITED1-209ENST00000453707 SYNJ1O43426 1573 aa23.43■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 SYNJ2O15056 1496 aa23.43■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.41■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 ARAP1Q96P48 1450 aa23.41■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
CITED1-209ENST00000453707 PBRM1Q86U86 1689 aa23.35■■□□□ 1.33
CITED1-209ENST00000453707 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.34■■□□□ 1.33
CITED1-209ENST00000453707 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.3■■□□□ 1.32
CITED1-209ENST00000453707 TOP2BQ02880 1626 aa23.27■■□□□ 1.32
CITED1-209ENST00000453707 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.23■■□□□ 1.31
CITED1-209ENST00000453707 GRIN2AQ12879 1464 aa23.19■■□□□ 1.3
CITED1-209ENST00000453707 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.17■■□□□ 1.3
CITED1-209ENST00000453707 ADAMTS12P58397 1594 aa23.15■■□□□ 1.3
CITED1-209ENST00000453707 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.12■■□□□ 1.29
CITED1-209ENST00000453707 NUP160Q12769 1436 aa23.09■■□□□ 1.29
CITED1-209ENST00000453707 CEP170Q5SW79 1584 aa23.06■■□□□ 1.28
CITED1-209ENST00000453707 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23■■□□□ 1.27
CITED1-209ENST00000453707 JPH4Q96JJ6 628 aa22.99■■□□□ 1.27
CITED1-209ENST00000453707 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CITED1-209ENST00000453707 KIF27Q86VH2 1401 aa22.93■■□□□ 1.26
CITED1-209ENST00000453707 SHROOM2Q13796 1616 aa22.91■■□□□ 1.26
CITED1-209ENST00000453707 IGF1RP08069 1367 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms