Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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USP46P62068 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP46P62068 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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USP46P62068 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP46P62068 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP46P62068 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP46P62068 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
USP46P62068 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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USP46P62068 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
USP46P62068 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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