Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMUB2Q71RG4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms