Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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