Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPRJQ12913 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms