Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX1P83916 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX1P83916 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CBX1P83916 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms