Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNB3P54284 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms