Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms