Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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