Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GIT1Q9Y2X7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GIT1Q9Y2X7 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms