Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSPP1Q1MSJ5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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